Transplantát se vzorky je po zamrazení vyjmut z komory zamrazovacího zařízení a následně je přemístěn k uskladnění do předem označeného sektoru skladovacího biologického kontejneru. Transplantát je v biologickém kontejneru uskladněn až do doby propuštění k autologní transplantaci (použití pouze pro vlastní potřebu).
Transplantát kmenových buněk může být v biologických kontejnerech uskladněn po řadu let. Podmínky skladování jsou přísně kontrolovány Státním ústavem pro kontrolu léčiv.
U každého štěpu pupečníkové krve se pro ověření kvality provádějí mikrobiologické a kultivační testy, jejichž výsledky známy krátce po uskladnění. Na základě serologických výsledků žilní krve matky, mikrobiologických a kultivačních výsledků a kvality buněk je vyhotoven Certifikát a zaslán rodičům.
Další vyšetření vzorků transplantátů jsou provedena na žádost transplantačního centra před případnou transplantací.
