Odebraná pupečníková krev a tkáň pupečníku se zpracovávají ve specializované laboratoři Cord Blood Centra CZ, která je držitelem všech potřebných povolení Ministerstva zdravotnictví ČR. Zpracovatelská laboratoř podléhá velmi přísným bezpečnostním a hygienickým opatřením. Zpracování provádí kvalifikovaný personál v laminárních boxech, které filtrují vzduch a tím výrazně snižují riziko infekce. Očištěný odběrový vak se označí jedinečným číselným kódem, zjistí se objem a množství jaderných buněk. Po centrifugaci se krev přemístí z odběrového vaku do speciálního vaku odolného vůči nízkým teplotám. Po kontrole kvality takto zpracovaného transplantátu se vak v ochranném kovovém pouzdře spolu s potřebnými vzorky umístí do kryokonzervačního (zmrazovacího) zařízení a zamrazí se na teplotu -180 °C. Po zamrazení se transplantát hermeticky uzavřený ve speciálním vaku v ochranném pouzdře vloží do biologického kontejneru, ve kterém se dlouhodobě skladuje.
.