Kryovak s pupečníkovou krví se vloží do ochranného kovového pouzdra a spolu s ostatními vzorky se umístí do zamrazovacího přístroje. Postupné zamrazování se uskutečňuje pomocí tekutého dusíku, dokud se nedosáhne požadované teploty -196°C. .
Celý proces zamrazování je přísně kontrolovaný proces. Kontroluje se průběh, aktuální teplota v komoře a celková standardnost procesu. Po ukončení procesu se kontroluje zmrazovací křivka, která musí být v souladu s validacíProč je vůbec třeba dát zamrazit pupečníkovou krev? Život v buňce se zamrazením prakticky zastaví a po celou dobu uskladnění se buňka téměř nemění. Proto i po následném rozmrazení je vlastně tak stará, jako byla v době zamražení, i když to bylo před mnoha lety.